Het klimaat is, vooral in de Franse Jura, vochtig en 's winters ruw en koud. Er valt vrij veel regen behalve in het midden van de zomer. De zomers zijn, in tegenstelling tot bijvoorbeeld in de Alpen, niet uitgesproken warm. Het klimaat in de Jura is een beetje te vergelijken met het weer in Nederland. Hoewel het er in de zomer minder regent en warmer is.
In de maanden juni tot en met september kan het kwik gemakkelijk oplopen tot ver boven de 20 graden Celsius.