Er zijn grote verschillen als gevolg van de geografische verscheidenheid. In het zuiden en midden is er overwegend een woestijnklimaat met een koel en droog seizoen van december tot maart. Een warm en droog seizoen van maart tot juni en de moessonperiode in juli en augustus. In het noorden is het koeler in de zomer en koud in de winter.
Pakistan is vrij droog, maar het gebied dat zich uitstrekt vanaf Lahore tot aan de berghellingen ten noorden van Islamabad krijgt te maken met de zuidwestmoesson. Deze bereikt Pakistan in juli en zorgt voor zware zomerstormen en regenval tot september.